刘刚
30多年前，Sanger首次建立了DNA双脱氧测序技术，完成了第一个完整基因组图谱的绘制。时至今日，由于DNA测序技术的改进，测序的规模也从以往每天只能测定几千个碱基序列发展到了如今的一次进行成千上万个序列精确测定的水平，同时该技术的发展也使得对一个物种的基因组和转录组进行全面的分析成为可能，基因方面的研究逐步进入了基因组和后基因组时代。这种以一次并行对几十万到几百万条DNA分子的序列测定和一般读长较短等为标志的技术称为高通量测序技术（High-through⁃putSequencing，HTS），其中主要包括以
Illumina/Solexa、Roche/454、ABI/SOL⁃ID为代表的第二代测序技术、单分子测序为代表的第三代测序技术以及IonTorrent测序技术。HTS有诸多优点，该技术的诞生使得更多的科学家意识到测序技术在生命科学中的应用前景，并已将其广泛应用于动植物基因组学、转录组学以及表观组学等方面的研究。但是对于哺乳类动物，由于其基因组的复杂性，测序仍是一个很大的挑战。
目前，基于DNA芯片的SNP检测平台以及功能成为高通量、大规模、全基因组SNP检测分析的主流技术。其中典型的代表是Affymetrix公司的SNP检测高密度DNA微阵列芯片和Illumina公司的SNP检测芯片，如Beadlab平台，是Illu⁃mina公司整合GoldenGate多通道位点特异性延伸扩增检测方案和BeadArray高密度微阵列技术。IIIuminaSNP分型技术是目前世界上在农业领域应用得较多的基因分型技术之一。以GoldenGate为例，一次可以同时检测102个~106个SNP位点，平均每天可以完成上千个样品的基因分型，其再现性大于99.9%，孟德尔遗传错误率小于0.1%。
从第一代Sanger测序法的问世到如今高通量测序法的广泛应用，陆续揭秘了海量的遗传信息。并且测序趋势一直向着快速、高通量、耗资少、准确率高的方向发展。高通量测序技术所带来的影响是很深远的，由于该技术的开发，促进了许多先前无法想象的科学成就的顺利完成以及更多生物信息技术的进步。目前，高通量测序技术在人类和动植物基因组学研究领域已经成为最热门的话题，与传统Sanger测序方法相比，它的优势是非常显著的。尽管该技术有诸多的优势，但是新的测序技术在继续不断地开发的同时，同样会面临一些困难，如何解决这些困难将是未来科学家们要着重解决的问题之一。相信不久的将来，测序技术上的革新会给我国畜禽遗传资源保护领域带来新的突破与发现。
（本栏稿件由农业部种畜品质监督检验测试中心提供）
