当日17时，农业部在其官网发布《关于“农业部转基因动物及饲料安全监督检验测试中心（北京）”有关问题调查处理情况的通报》称，被举报的“农业部转基因动物及饲料安全监督检验测试中心（北京）”确实存在举报信中所说的部分违规行为，已令其限期整改。
举报人：“报告也有袒护的嫌疑”
此事的举报人魏景亮向澎湃新闻表示，农业部反应及时，没有回避其举报内容，都一一作了回应。
“报告证实了我举报信中提到的档案造假、用实验技能不熟练的研究生顶替进行检测以及与研究生签订虚假劳动合同等问题，这说明检测中心在工作程序上是存在问题的。”但魏景亮质疑，程序出现了问题，通报却说不存在检测工作和检测数据造假问题，“我不知道这是不是矛盾的。”
澎湃新闻还注意到，魏景亮随后在微信朋友圈也发表了相应看法。他认为，农业部的调查速度和态度让人满意，但是这份报告也有袒护的嫌疑。
首先是调查报告提到2011-2015的检测试验任务检测程序和检测数据没有问题，魏景亮认为，在这个时间段没有实验过程记录也没有质量控制，更没有符合资质的人员，“怎么能得出没有问题的结论”?
其次，魏景亮还认为，2011年的资质认证涉及到这四年中心资质是否合法的问题，也没有调查。此外，他还表示，调查组在调查过程中没有联系他本人。
22日上午，魏景亮在其发表的题为《为什么质量控制与档案记录对检测结果至关重要？》的文章中表示，质量控制并不是检测试验的细枝末节，并不是不重要的“面子工作”,而是确保检测结果准确的主体部分。
农业部：有违规行为，限期整改
农业部在上述通报中称，农业部于9月20日上午派出联合调查组，对举报的问题进行了逐一调查核实。经调查组核查，为接受复评审工作，检测中心于2015年5月至7月突击补充了检测练兵、能力比对、材料领取、仪器使用、人员培训、内审会议记录等档案材料，违反了检测中心档案管理有关规定。
此外，举报信中提到的“用实验技能不熟练的研究生顶替进行检测以及研究生签订虚假劳动合同”问题，也得到了回应。经调查组核查，2015年复评审期间，有4名在读研究生被该中心聘为检测员、档案员，聘用合同甲方为北京畜牧兽医研究所，而印章是农业部转基因动物及饲料安全监督检验测试中心。另外，复评审现场考核时，部分检测任务由在读研究生顶替检测员开展检测试验。以上均违反了检测中心人员管理的有关规定。
对于魏景亮在举报信中提到的疑似出具虚假检测报告的情况，通报指出，检测中心仅在2011年12月接受农业部科技发展中心委托的2项试验检测任务，按照专家论证的检测方案开展了室内和室外检测工作，并于2015年10月出具了相关报告，有检测过程和检测数据等原始记录，不存在检测工作和检测数据造假问题，但未将原始记录等材料交档案管理员归档。该中心至今未出具过已获安全证书转基因产品的检测报告。
