作为国际小麦基因组测序联盟成员,西北农林科技大学研究人员于2016年底率先获得了内部共享、尚未发表的六倍体小麦参考基因组信息,对来自全世界的93个野生小麦、六倍体农家种和主栽品种开展全基因组重测序。面对高重复的多倍体基因组分析难题,他们通过开发新的分析流程,建立了全面的小麦变异组信息,揭示了全球最广泛种植的作物——六倍体小麦各亚基因组的遗传变异、群体内和群体间的遗传分化程度、驯化和改良阶段的受选择信号等全方位的变异系谱和变异来源。
这一首个大规模全基因组重测序研究,提供了目前数量最多、覆盖最全的六倍体小麦及其野生祖先的基因组变异集合,筛选出来自多个野生小麦群体和远源物种的大量基因渗入,其中一些渗入片段在群体中的出现频率随着驯化或改良显著增加。频率改变并与已知数量性状连锁区域的重叠,提示这些片段在驯化和改良过程中可能扮演重要角色。
该研究将为了解小麦起源、进化和驯化历史,克服小麦遗传资源同质化,促进小麦遗传改良提供重要的数据资源。
相关论文信息:http://doi.org/10.1186/s13059-019-1744-x