一是提高肥效有机肥在腐烂过程中产生大量有机酸，能促进难溶磷的分解转化，有利于作物根系吸收利用，减少磷素固定。
二是避免烧苗过磷酸钙含游离酸较多，若直接施用，用量稍大时易发生烧种烧苗现象。若将磷肥与畜粪混和堆沤施用，则可避免这种现象的发生。
三是增加养分磷肥成分单一，而有机肥养分完全，二者混合后，既能满足作物对多种养分的需要，又能以磷保氮，以氮促磷，减轻氮素的挥发。
磷肥易被土壤固定，在土壤中移动性差，作物难以吸收利用。若将其与畜粪混合再堆沤发酵，然后施在地里作基肥，增产效果十分明显。其好处主要表现在以下几点：