长期贮藏的石榴宜在秋分到寒露时采收。采收时严禁碰伤、摔伤果实。
石榴的耐贮性好，晚熟品种可贮藏到翌年4月。石榴属喜湿性果树，其果实在0℃时容易出现低温伤害，因此不宜在冷库中贮藏。适宜的贮藏温度为5℃。由于石榴果皮易失水皱缩，贮藏环境要求有较高的相对湿度，一般为90%~95%.贮藏过程中果实易感染病菌，发生烂果。因此，在贮藏前应进行杀菌消毒处理。常用的贮藏方法有以下两种：
1、干井贮藏。选干燥的地方，挖口径80厘米、深2米的干井，在井底挖几个拐洞用来堆放石榴。贮藏前，用50%的多菌灵可湿性粉剂800倍液或石榴保鲜剂2号800~1000倍液喷石榴。然后按大、中、小分级堆放，并且每隔10~15天检查1~2次，清除烂果。
2、聚乙烯塑料袋温室贮藏。选择无病虫、无碰伤的优质果，用40%的多菌灵可湿性粉剂800倍液浸果1分钟，晾干后装入聚乙烯袋内，并放在阴凉的室内，贮存140天仍新鲜如初。