新鲜辣椒含水量较高，容易腐烂变质，从而影响椒农的收入。只有大力发展辣椒深加工，才能延长辣椒食品保质期、提高辣椒附加值、增加农民收入。
不过，在全国范围内，辣椒食品加工企业很多，竞争也很激烈，行业存在产品结构雷同、低价恶意倾销等问题，不少企业因此陷入微利甚至亏损的状态，影响了辣椒产业的健康发展。
专业开发蔬菜防腐保鲜技术的南通圣唐生物化工科技开发中心的唐洪权先生认为，要发展辣椒食品加工业，必须从多方面采取有效措施，如提高辣椒食品质量、延长辣椒食品保质期、加大辣椒食品新产品开发力度、构建科学有效的营销渠道。
积极开发辣椒食品新产品，是推动辣椒食品加工业的第一大措施。以辣椒为原料，可加工成辣椒粉、辣椒干、辣椒酱、泡椒、剁椒、辣椒油、辣酱油等辣椒食品以及辣椒精、辣椒素、辣椒色素等辣椒源食品添加剂。这些辣椒食品及添加剂的深加工程度、附加值不同，其对应的加工技术和加工设备也不同，不同的辣椒食品加工企业应根据自己的实际情况，量体裁衣，开发合适的产品，不要一味盲目求大求新，以免费时、费力、费钱，而又达不到相应的效果。
构建科学有效的营销渠道，是促进辣椒食品加工业发展的第二大举措。相对于肉制品、粮油制品、饮料等食品而言，辣椒食品虽不属于大宗食品产品，但其渗透到食品的多个方面，涉及的食品产品很多，其在食品行业和民众生活中的重要性也不可小觑。针对不同的地区、不同的客户群体，辣椒食品加工企业应采取不同的销售模式，如直销、开专卖店、代销，或者专门为经销商代工。某个辣椒食品加工企业自身的经济实力和营销能力如果不强的话，而又想将产品卖到外地，则不宜采用直销的模式，应在外地寻找经济实力强、诚信度高的食品经销商，由他们经销辣椒加工食品，以减少自身的风险。
专业研发辣椒食品防腐保鲜技术的南通圣唐生物化工科技开发中心的唐洪权先生指出，腐败变质、保质期短是目前制约辣椒食品产业发展的一大瓶颈。采用先进的食品防腐保鲜技术和食品保鲜剂，提高辣椒食品质量，是发展辣椒食品加工业的第三大措施。
据悉，南通圣唐生物化工科技开发中心和江南大学食品保鲜技术研究所合作，开发成功了“高效蔬菜防腐保鲜剂”。使用该蔬菜防腐保鲜剂，不用加热杀菌和冷藏，在常温条件下储藏，就能延长辣椒制品的保质期，并保留辣椒食品的良好风味和食疗价值。
辣椒风味独特、营养丰富，有多种保健功能：开胃消食、暖胃驱寒、促进血液循环、美容肌肤、减肥、止痛散热、抗癌、保护心脏、降血压、缓解糖尿病症状等。辣椒制品包括泡椒、剁椒、盐渍辣椒、辣椒酱等，大多数不宜高温杀菌，否则易破坏辣椒的良好风味和营养健康成分。
同其他食品一样，辣椒制品也会因微生物超标而变质。以泡椒为例，因微生物引发的质量问题主要有：1.产品因杂菌含量偏高，易腐败变质。微生物数量过高的原因包括：1）鲜辣椒、八角等原辅料使用前未杀菌，带菌量较高。2）加工和包装车间的卫生条件差，生产过程中受微生物污染。3）为保存产品风味和营养健康成分，不宜高温杀菌，使产品包装前的菌落数偏高。2.一些辣椒食品企业为防微生物超标，超范围、超量使用食品防腐剂。
保持较低的环境温度，降低物料的pH值和加工温度，真空或气调包装，降低原料初始带菌量，添加高效防腐保鲜剂，均可抑制微生物生长、延长泡椒等辣椒制品保质期。
南通圣唐生物化工科技开发中心与江南大学圣唐食品保鲜技术研究所合作，针对辣椒制品的安全质量问题，开发了系列新型高效蔬菜防腐保鲜剂，可用于原料清洗杀菌、加工过程防腐保鲜及加工后期防腐。使用该保鲜剂，可不用加热杀菌、不用冷藏，在常温条件下，就能降低原料和辣椒食品包装前的带菌量，抑制辣椒制品的腐烂，延长食品保质期，并保留辣椒食品的良好风味和营养健康功能。
高效蔬菜防腐保鲜剂的保鲜原理：降低所用原料、工器具及生产环境的微生物含量，减少生产中食品受微生物污染的机会。该复配防腐保鲜剂精选符合GB2760的高效安全的防腐剂、螯合剂、缓冲剂、pH调节剂，复配而成，可破坏微生物细胞壁、改变细胞膜通透性、阻止微生物细胞壁分裂繁殖，对特定的细菌、酵母菌、腐败菌、芽孢杆菌等有较强的抑制作用。