荸荠贮藏最适温度为0－－2℃，相对湿度98－－100%。贮藏方法有两种。
窖贮法。挖长、宽各100厘米，深80－－100厘米，底略宽的地窖，将食用荸荠铺入窖内，每放20－－25厘米厚的球茎，上撒0.5－－1.0厘米干细土一层，以吸收球茎中散出的水分。如此一层层堆积，至窖口20－－25厘米时，其上铺干细土封口，每窖贮放400－－500千克。旧窖使用前，应喷洒1%福尔马林溶液，密闭一昼夜消毒，后敞开挥发一周，方可入窖贮藏。
堆藏法。将荸荠堆积在地面上，四周用窝席围住，窝席外用河泥涂抹，堆上盖土或稻草，并涂泥封顶。堆贮体积，根据藏量而定，堆藏方法与窖藏一样，一般高度不超过100厘米。