免疫是控制家畜传染病的手段，几乎所有畜群都需进行免疫接种。然而有些畜群经免疫接种后却不能抵御相应疫病的流行，旧病常发，新病迭出，造成免疫失败。导致这一现象的原因是多方面的，在实际工作中应全面考虑。
母源抗体的影响
由于各种疫苗在种畜中的广泛使用，可能使种畜的母源抗体水平提高，若接种过早，当疫苗病毒注入幼畜体内时，会被母源抗体中和，从而影响疫苗免疫力的产生。
疫苗的质量
疫苗保存不当或疫苗过期。
疫苗选择不当
有的疫苗有几个不同的品系，不同的品系毒力不同，若首免时选用独立较强的品系，不但起不到免疫保护作用，而且接种后还会引起发病，导致免疫失败。
疫苗使用不当
稀释剂选择不当：多数疫苗稀释时可用生理盐水或蒸馏水，个别疫苗需用专用稀释剂。若需用专用稀释剂的疫苗用生理盐水或蒸馏水稀释，则疫苗的效价就会降低，甚至完全失效。
用活疫苗免疫的同时使用抗生素类药物会影响免疫力的产生：表现为用疫苗的同时引用消毒水；饲料中添加抗生素类药物；紧急免疫的同时用抗生素药物进行防治。
盲目联合应用疫苗：主要表现为在同一时间内经不同的途径接种几种不同的疫苗。
免疫剂量不准：免疫剂量原则上必须按照说明书剂量为准，量不足不能激发肌体的免疫反应，量太多会产生免疫麻痹而使免疫力受到抑制。
免疫途径不当：免疫接种的途径取决于病原体的性质及侵入途径。
疫苗稀释后使用的时间过长：从零下几十度的冰箱中取出的冻干苗应放置一段时间，尽可能缩小与稀释剂的温差，以免由于温度骤升使疫苗中致弱的微生物夭折。疫苗稀释后要在30分钟~60分钟内用完。根据试验，疫苗稀释后使用的时间与免疫力产生的保护率存在负相关性，已知多数疫苗稀释的时间超过3小时再接种，对肌体的保护率为零。
免疫接种工作不够细：例如采用饮水免疫时饮水不足，进行疫苗稀释时计算错误或稀释不均匀，没有把应接种的畜只全部接种。
早期感染
接种时畜群内已潜伏强度病原微生物，或由于接种人员及接种用具消毒不严带入强毒病原微生物。
应激及免疫抑制因素的影响
饥饿、寒冷、过热、拥挤等不良因素的刺激，能抑制机体的体液免疫和细胞免疫，从而导致疫苗免疫保护力下降。
血清型不同
有的病原微生物有多个血清型，如果疫苗的血清与感染的病毒或细菌血清不同，则免疫后起不到保护作用。
