1、水浴式杀菌：杀菌时锅内食品全部被热水浸泡，通过压力和水泵促进循环，这种方式热分布比较均匀。
2、蒸汽式杀菌：以蒸汽为加热介质，直接进行升温。通过机械装置来保持蒸汽与空气混合，使其在杀菌釜内循环。由于在杀菌过程中锅内存在空气会出现冷点，所以这种方式热分布不是最均匀。
3、喷淋式杀菌：该方式分为顶淋式、侧喷式、全喷式。这种方式是采用喷嘴和喷淋管将热水喷射出雾状波浪形热水至食品表面，温度均匀无死角。水通过换热器进行加热和冷却，升温和冷却速度迅速，能高效、全面的对产品进行杀菌。
从锅体材质上分为四种
1、全钢A型：杀菌锅全部采用不锈钢制作。
2、全钢B型：杀菌锅的锅体与夹套采用不锈钢制做，架体采用碳钢制作。
3、半钢型：产品锅体采用不锈钢，夹套架体采用碳钢制作。
4、碳钢型：产品全部采用碳钢制作。
从控制方式上分为五种:
1、手动控制型：
所有阀门和水泵均由人工手动控制，包括加水、升温、保温、降温等工序。
2、电气自动控制型：
压力由两个电接点压力表控制，一个控制排压，一个控制补压；温度由传感器（pt100）和温控仪控制（精度为±1℃），降温过程由手动操作。
3、电脑半自动控制型:
采用PLC和文本显示器将采集的压力传感器信号和温度信号进行处理，可以储存杀菌工艺，控制精度高，温控可达±1℃，降温过程由人工手动操作。
4、电脑全自动控制型：
杀菌全程由PLC和触摸屏控制，可以储存杀菌工艺，操作工只需按启动按钮即可，杀菌完毕后自动报警，温控精度可达±0.5℃。
5、电脑远程控制型
通过电脑远程控制自动进出料装卸、杀菌等，达到数字化机械化，真正实现车间无人化操作，节省人力,大大提高生产效率。
从罐体结构上分为七种：
1、单罐杀菌锅
2、双层杀菌锅
3、双锅并联式杀菌锅
4、三锅并联式杀菌锅
5、卧式杀菌锅
6、电汽两用杀菌锅
7、旋转式杀菌锅