CIP清洗系统除了靠溶液浸渍软化污物之外，其主要原理是利用洗剂溶液之化学能，将污物之蛋白质、脂肪及碳水化合物，加以溶解、水解、皂化。然后利用洗剂溶液在管件中流动产生扰流的运动能，去除管件表面已被分离、溶化，分解、乳化、皂化的污物。同时利用桶槽内的喷雾洗涤装置，淋洗桶槽内部表面。
CIP清洗装置具有以下的优点：
1、CIP清洗系统分手动、半自动及全自动三种供用户选择
2、 与手洗相比，不但没有因作业者之差异而影响清洗效果，还能提高其产品质量。
3、能防止清洗作业中的危险，节省劳动力。
4、 可节省清晰剂、蒸汽、水及生产成本。
5、 能增加机器部件的使用年限。
6、 CIP清洗系统能使生产计划合理化及提高生产能力。