1．选择适合当地条件、生长健壮的畜禽作为有机畜禽生产系统的主要品种．在繁殖过程中应尽可能减少品种遗传基质的损失，保持遗传基质的多样性。
2．可以购买不处于妊娠最后三分之一时期内的母畜。但是，购买的母畜只有在按照有机标准饲养一年后，才能作为有机牲畜出售。可从任何地方购买刚出壳的幼禽。
3．根据牲畜的生活习性和需求进行圈养和放养。给动物提供充分的活动空间、充足的阳光、新鲜空气和清洁的水源。
4．因养绵羊、山羊和猪等大牲畜时，应给它们提供天然的垫料。有条件的地区，对需要放牧的动物应经常放牧。
5．牲畜的饲养环境应清洁和卫生。不在消毒处理区内饲养牲畜，不使用有潜在毒性的材料和有毒的木材防腐剂。
6．通常不允许用人工授精方法繁殖后代。严禁使用基因工程方法育种。禁止给牲畜预防接种(包括为了促使抗体物质的产生而采取的接种措施)。需要治疗的牲畜应与畜群隔离。
7．不干涉畜禽的繁殖行为，不允许有割禽畜的尾巴、拔牙、去嘴、烧翅膀等损害动物的行为。
8．屠宰场应符合国家食品卫生的要求和食品加工的规定，宰杀的有机牲畜应标记清楚，并与未颁证的肉类分开。有条件的地方，最好分别屠宰已颁证和未颁证的牲畜，屠宰后分别挂放或存放。
9．在不可预见的严重自然、人为灾害情况下，允许反刍动物消耗一部分非有机无污染的饲料，但其饲料量不能超过该动物每年所需饲料干重的10％。
10．人工草场应实行轮作、轮放，天然牧场避免过度放牧。
11．禁止使用人工合成的生长激素、生长调节剂和合成的饲料添加剂。