1）至少抽取2-6 份连续获得认证的组织的审核档案；
2）档案应覆盖认证机构全部认证范围（如种植、养殖、水产、加工）；
3）从检查人员名录中随机抽取三名检查员，对他们所作的项目进行检查，以验证其技术能力。（避免与其他档案重复）对抽查的档案进行检查，重点关注：
1．查看认证机构是否进行了文件审核，主要看是否有相关的文审报告或意见等纪录。（由于文审的形式比较多样，不同的认证机构可能采取不同的形式，因此在监督检查时应首先看认证机构是否有认证审核的相关规定，然后根据规定中对于文审的要求进行检查。）
2．查看检查计划，关注以下几个方面：
①是否包含了检查依据、检查内容、检查场所及时间安排等基本要素；
②检查日期是否在申请认证的产品生产或加工过程的适当阶段；
③现场检查人员是否具有相应的资质。
④是否经过CCAA 注册，查注册证书号。
3．查看检查纪录，关注以下几个重点：
①对于生产检查，是否对转换期进行了评价,评价结论是否合适；
②是否对投入品、特别是禁止使用的物质进行了检查和评价；
③是否对产地环境质量状况及其对有机生产和加工可能产生的污染进行了风险评估；
④是否对使用转基因技术及其产品进行了检查和评价；
⑤如果怀疑申请人使用了认证标准中禁止使用的物质，或者产地环境、产品可能受到污染等情况，是否采集样品进行检测；
4．查看检查报告，关注：
①是否有审核组长和申请人的签字确认；
②是否对获证企业针对开具的不符合项进行的整改情况进行验证。
5．查看机构有机产品认证证书和有机转换产品认证证书是否符合国家认监委规定的基本格式，如是否包含获证组织的名称、获证产品的种类数量、依据的标准以及认证类别等基本要素。
6．查看监督评审记录，关注以下几个要点：
①是否对获证者实施每年至少一次的监督检查，即监督检查的间隔是否超过12 个月；
②监督检查过程中，是否对上一年度开具的不符合项整改情况进行了追踪检查和评价；
③获证后发生的变更情况；