各类绿色食品管理服务机构是我国绿色食品产业发展的组织依托。
中国绿色食品发展中心是组织和指导全国绿色食品产业发展的权威管理机构，也是绿色食品商标标志的所有者。为了将分散的农户和企业组织发动起来进入绿色食品的管理和开发序列，中国绿色食品发展中心在全国构建了三个组织管理系统，并形成了高效的网络：
一是在全国各地委托了分支管理机构，协助和配合中国绿色食品发展中心开展绿色食品宣传、发动、指导、管理、服务工作；
二是委托全国各地有省级计量认证资格的环境监测机构负责绿色食品产地环境监测与评价；
三是委托区域性的食品质量监测机构负责绿色食品产品质量监测。绿色食品组织网络建设采取委托授权的方式，并使管理系统与监测系统分离，这样不仅保证了绿色食品监督工作的公正性，而且也增加了整个绿色食品开发管理体系的科学性。
中国绿色食品协会作为全国性的专业协会，将为我国绿色食品事业的健康发展提供有效的综合服务和有力的社会支持。